SSH接続とかで使えるはず
nemusg.comをコピーしてnemusg.com.140803を作成したい場合
cp -Rp nemusg.com nemusg.com.140803
特定のフォルダなどを除外したcpをしたい場合rsyncのが楽らしい
$ rsync [[オプション] コピー元 コピー先
(例)nemusg.comをコピーしたいが、nemusg.com/cache/ だけ除外したい場合
rsync -a nemusg.com/ nemusg.com.140803/ --exclude "/cache/"